Identification of Scolopendra Dispensing Granules by Allele-specific PCR

XU Yuansheng; HU Li; JIANG Chao; ZHAO Yuyang; CHEN Tianyun; ZHANG Hui; TIAN Hui; YUAN Yuan

doi:10.13422/j.cnki.syfjx.20231111

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Identification of Scolopendra Dispensing Granules by Allele-specific PCR

更新时间：2024-01-15

- Identification of Scolopendra Dispensing Granules by Allele-specific PCR
  增强出版
- Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae Vol. 30, Issue 4, Pages: 48-54(2024)
- 作者机构：
  
  1.广西中医药大学，南宁 530200
  2.中国中医科学院中药资源中心，北京 100700
  3.华润三九现代中药制药有限公司，广东深圳 518029
- 作者简介：
- 基金信息：
- DOI：10.13422/j.cnki.syfjx.20231111
  CLC： R284.2;R289;R287;R22;R2-031;R33;R24
- Received：08 May 2023，
  
  Published Online：01 September 2023，
  
  Published：20 February 2024
- 稿件说明：
移动端阅览
许源升,胡力,蒋超等.蜈蚣配方颗粒的位点特异性PCR鉴别[J].中国实验方剂学杂志,2024,30(04):48-54.

XU Yuansheng,HU Li,JIANG Chao,et al.Identification of Scolopendra Dispensing Granules by Allele-specific PCR[J].Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2024,30(04):48-54.
许源升,胡力,蒋超等.蜈蚣配方颗粒的位点特异性PCR鉴别[J].中国实验方剂学杂志,2024,30(04):48-54. DOI： 10.13422/j.cnki.syfjx.20231111.

XU Yuansheng,HU Li,JIANG Chao,et al.Identification of Scolopendra Dispensing Granules by Allele-specific PCR[J].Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2024,30(04):48-54. DOI： 10.13422/j.cnki.syfjx.20231111.

摘要

目的

为进一步保障蜈蚣药材及其制品的质量与临床疗效，建立蜈蚣配方颗粒特异性聚合酶链式反应（PCR）鉴别方法。

方法

根据蜈蚣细胞色素C氧化酶亚基3（COX-3）基因序列筛选适用于蜈蚣配方颗粒的稳定引物区间，并在区间内筛选获得蜈蚣及其混伪品的单核苷酸多态性（SNP）位点，设计特异性鉴别引物。分别收集蜈蚣及其混伪品，考察退火温度、循环次数、不同

Taq

酶、DNA模板量、不同PCR仪、不同引物量等因素对PCR鉴别方法的影响，建立并优化PCR反应体系，并对此方法的专属性及适用性进行考察验证。

结果

PCR鉴别反应体系为2×M5 PCR Mix 12.5 μL，蜈蚣配方颗粒鉴别引物（10 μmol·L

-1

）各0.4 μL，DNA模板2.5 μL，无菌双蒸水9.2 μL。PCR反应参数为94 ℃预变性3 min，循环反应30次（94 ℃变性20 s，62 ℃退火20 s，72 ℃延伸45 s），72 ℃延伸5 min。利用上述PCR反应体系和反应参数对蜈蚣药材及其制品进行扩增，电泳检测结果表明所有正品均可在约135 bp处显示出一条明亮条带，而混伪品无条带。

结论

建立的特异性PCR鉴别方法可准确对蜈蚣药材、饮片、标准汤剂冻干粉、配方颗粒中间体、配方颗粒成品进行准确鉴别，为进一步保障蜈蚣药材及其制品的质量具有重要意义。

Abstract

Objective

To establish an allele-specific polymerase chain reaction （PCR） method for identifying Scolopendra dispensing granules， so as to ensure the quality and therapeutic effects of Scolopendra and its preparations.

Method

The primer interval suitable for the PCR was selected based on the cytochrome c oxidase subunit 3（COX-3） gene sequence of Scolopendra， and the single nucleotide polymorphism （SNP） loci of Scolopendra

and its adulterants were mined from the interval for the design of specific primers. The samples of Scolopendra and its adulterants were collected. The PCR system was established and optimized regarding the annealing temperature， cycles，

Taq

enzymes， DNA template amount， PCR instruments， and primer concentrations， and the specificity and applicability of this method were evaluated.

Result

The PCR system was composed of 12.5 μL 2×M5 PCR Mix， 0.4 μL forward primer （10 μmol·L

-1

）， 0.4 μL reverse primer （10 μmol·L

-1

）， 2.5 μL DNA template， and 9.2 μL sterile double distilled water. PCR parameters： Pre-denaturation at 94 ℃ for 3 min， 30 cycles （94 ℃ for 20 s， 62 ℃ for 20 s， 72 ℃ for 45 s）， and extension at 72 ℃ for 5 min. After PCR amplification with the system and parameters above， the electrophoresis revealed a bright band at about 135 bp for Scolopendra and no band for the adulterants.

Conclusion

The established allele-specific PCR method can accurately identify the medicinal materials， decoction pieces， and standard decoction freeze-dried powder of Scolopendra， as well as the intermediates and final products of Scolopendra dispensing granules， which is of great significance for ensuring the quality and clinical efficacy of Scolopendra and its preparations.

关键词

Keywords

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