Construction of Literature Knowledge Ontology for Traditional Chinese Medicine Clinical Trials： A Review

CHEN Qi; LI Qin; ZHANG Jundong; LIU Lihong; YANG Shuo

doi:10.13422/j.cnki.syfjx.20231115

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Construction of Literature Knowledge Ontology for Traditional Chinese Medicine Clinical Trials： A Review

更新时间：2023-09-21

- Construction of Literature Knowledge Ontology for Traditional Chinese Medicine Clinical Trials： A Review
- Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae Vol. 29, Issue 20, Pages: 190-197(2023)
- 作者机构：
  
  1.中国中医科学院中医药信息研究所，北京 100700
  2.南京大学信息管理学院，南京 210000
- 作者简介：
- 基金信息：
- DOI：10.13422/j.cnki.syfjx.20231115
  CLC： R284;R285;R289;R287;R22;R2-031;R33;R24
- Received：19 April 2023，
  
  Published Online：05 September 2023，
  
  Published：20 October 2023
- 稿件说明：
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陈琦,李芹,张君冬等.中医临床试验文献知识本体的构建[J].中国实验方剂学杂志,2023,29(20):190-197.

CHEN Qi,LI Qin,ZHANG Jundong,et al.Construction of Literature Knowledge Ontology for Traditional Chinese Medicine Clinical Trials： A Review[J].Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2023,29(20):190-197.
陈琦,李芹,张君冬等.中医临床试验文献知识本体的构建[J].中国实验方剂学杂志,2023,29(20):190-197. DOI： 10.13422/j.cnki.syfjx.20231115.

CHEN Qi,LI Qin,ZHANG Jundong,et al.Construction of Literature Knowledge Ontology for Traditional Chinese Medicine Clinical Trials： A Review[J].Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2023,29(20):190-197. DOI： 10.13422/j.cnki.syfjx.20231115.

摘要

目的

为有效组织中医临床试验文献中蕴含的中医和循证医学交叉学科知识，便于对多源数据进行处理和映射，该文通过本体建模实现对中医临床试验文献的知识组织。

方法

使用七步法和骨架法结合进行本体开发，通过分析中医临床试验文献的结构和语言特点，复用科学证据来源信息本体（SEPIO）顶层框架和中医药语言系统（TCMLS）等本体资源和非本体资源，确定领域概念和属性关系，最终确定疾病、证候、症状、分组、干预措施、结局指标、文献质量信息等核心概念和属性关系。

结果

将中医临床试验文献中所蕴含的信息分为5类，根据Cochra ne ROB偏倚风险评估工具和CONSORT 2010声明等资源，将文献质量评价信息映射到本体中，共建立了68个类，8个对象属性，38个数据属性，基本实现了临床试验文献结构化表达。

结论

研究构建的中医临床试验文献本体能够更好地组织、利用和呈现中医临床试验文献内部知识体系的构建和关联，为后续证据强度及诊疗信息推理的实现奠定良好的基础。

Abstract

Objective

To effectively organize the interdisciplinary knowledge of traditional Chinese medicine （TCM） and evidence-based medicine contained in the clinical trial literature of TCM and facilitate the processing and mapping of multi-source data， this paper organized the knowledge of clinical trial literature of TCM by ontology modeling.

Method

The seven-step method and skeleton method were used to develop the ontology. After the structure and language characteristics of TCM clinical trial literature were analyzed， the ontological and non-ontological resources such as top-level framework of Scientific Evidence and Provenance Information Ontology （SEPIO） and TCM language system （TCMLS） were reused to determine the domain concepts and attribute relationship. Finally， the core concepts and attribute relationship such as disease， syndrome， symptom， grouping， intervention measures， outcome indicators and literature quality information were determined.

Result

The information contained in the clinical trial literature of TCM was divided into five categories. According to the Cochrane risk of bias assessment tool and CONSORT 2010 statement， the literature quality evaluation information was mapped to the ontology， and a total of 68 categories， 8 object attributes， and 38 data attributes were established， which basically realized the structured expression of clinical trial literature.

Conclusion

The ontology of TCM clinical trial literature constructed in this study can well organize， utilize， and present the construction and association of internal knowledge system in TCM clinical trial literature， underpinning the reasoning of strength of evidence and information of diagnosis and treatment in the future.

关键词

Keywords

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