الهدف من هذه الدراسة هو استخدام الحوسبة الحيوية والتجارب الحيوانية لاستكشاف الآليات الكامنة لعلاج ذات المعدرة القرحية (UC) من خلال تنظيم التفتت الخلوي. الطريقة تتضمن البحث عن الجينات المعبرة عنها بشكل مختلف في أنسجة القولون لمرضى UC من قاعدة بيانات إكسبريشن جينومية متكاملة (GEO)، والبحث عن الجينات ذات الصلة بالتفتت الخلوي من خلال GEO وقاعدة بيانات جينكاردز، ثم استخدامهم للتحليل الوظيفي الجيني وتحليل مسارات جينية في قاعدة بيانات ميتاسكيب، وتشكيل شبكة تفاعلات بروتينية من خلال قاعدة بيانات سترينغ، وبناء نموذج التنبؤ باستخدام تقنية الضم والاختيار الخطي مع توثيق الأداء من خلال ميزان المحتوى الإيجابي للمستقبلات (ROC)، وتحليل التسلسل الزمني للحمض النووي الريبي المشتق (Real-time PCR) لمستويات رنا ملونات مع مراقبة مستويات البروتين بواسطة التحليل الفوتومتري. نتائج المنهج المرقم بالتسلسل GSE87466 وGSE87473 من قاعدة بيانات GEO، أظهرت 64 جينا معبرا عنها بشكل مختلف، وتبين نتائج تحليل مسارات جينية ميتاسكيب أن معظم هذه الجينات متابعة مسارات استقبال مثل NOD ومسارات الإشارة TNF ومسارات HIF-1. تبين عند مراجعتها أن التعبير عن هذه الجينات مرتبط بالخلايا الضخمة والخلايا النيوتروفيلية والماكروفاجات مونوسيت النوع M0 وماكروفاجات النوع M1 والخلايا الدغرية. تبين نتائج التجربة أن محتويات الكولون من الإنترلوكين-1β و-18 ترتفع بشكل ملحوظ مقارنة بالمجموعة الطبيعية، في حين تنخفض محتويات الإنترلوكين-10 و-ة النمو والتحول (TGF-β( بشكل ملحوظ. كما أن تلوين caspase-1 وGJA1 وS100A8 له شدة كبيرة ومساحة كبيرة، كما تزيد تركيزات رنا caspase-1 وGJA1 وS100A8 وتعبيرها المفاهيمي بشكل ملحوظ (P <0.01). أما تعبير caspase-1 وGJA1 وS100A8 وPPARG في حالة الحيوان الطبيعي، ففي حالة الحيوان المعاقة للمحاكاة، يظهر تشويه متمثل في انخفاض ملحوظ (P <0.01).
关键词
الحوسبة الحيوية; تنظيم التفتت; الكوليت القرحي; الالتهاب