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Aufdeckung des molekularen Mechanismus von Ma Xing Shi Gan Tang zur Behandlung von Pneumonie basierend auf traditioneller chinesischer Medizin-Transkriptom- und Strukturdaten

  • role： First author第一作者
  • Affiliation：

    Shanxi Key Laboratory for Modernization of Traditional Chinese Veterinary Medicine， College of Basic Sciences， Shanxi Agricultural University， Jinzhong 030801， China

  • Email：18232320334@139.com
  • Introduction：王英东，在读硕士，从事中药治疗疾病机制研究，E-mail：18232320334@139.com
WANG Yingdong1,  
  • Affiliation：

    Shanxi Key Laboratory for Modernization of Traditional Chinese Veterinary Medicine， College of Basic Sciences， Shanxi Agricultural University， Jinzhong 030801， China

PENG Haoyang1,  
  • Affiliation：

    Shanxi Key Laboratory for Modernization of Traditional Chinese Veterinary Medicine， College of Basic Sciences， Shanxi Agricultural University， Jinzhong 030801， China

WANG Aoyi1,  
  • Affiliation：

    Shanxi Key Laboratory for Modernization of Traditional Chinese Veterinary Medicine， College of Basic Sciences， Shanxi Agricultural University， Jinzhong 030801， China

ZHANG Wuxia1,  
  • role： Corresponding author通信作者
  • Affiliation：

    School of Traditional Chinese Medicine， Beijing University of Chinese Medicine， Beijing 100029， China

  • Email：bc@bucm.edu.cn
  • Introduction：白辰，博士，副研究员，硕士生导师，从事中药复方防治温病、疫病的作用机制及生物信息研究，E-mail：bc@bucm.edu.cn；
BAI Chen2*,  
  • role： Corresponding author通信作者
  • Affiliation：

    Shanxi Key Laboratory for Modernization of Traditional Chinese Veterinary Medicine， College of Basic Sciences， Shanxi Agricultural University， Jinzhong 030801， China

  • Email：lip@sxau.edu.cn
  • Introduction：李鹏，博士，教授，博士生导师，从事中药治疗疾病机制研究，E-mail：lip@sxau.edu.cn
LI Peng1*

Resümee

Ziel ist es, die Struktur der Komponenten von Ma Xing Shi Gan Tang und Transkriptomdaten zu kombinieren, um den molekularen Wirkmechanismus der Behandlung von Pneumonie auf Zielebene systematisch zu erforschen. Die Methode verwendet das zuvor entwickelte systemische Netzwerkpharmakologiemodell NP-TCMtarget, das auf Arzneimitteltargets fokussiert, um basierend auf Transkriptomdaten der Ma Xing Shi Gan Tang-Gruppe und des Pneumoniemodells Wirkungstargets der Behandlung zu identifizieren und die strukturellen Targets auf Basis der Strukturinformationen der Wirkstoffkomponenten vorherzusagen. Durch die Kreuzkorrelation der Wirkungstargets und strukturellen Targets wurden die direkten Targets der Pneumoniebehandlung enthüllt, verbleibende Wirkungstargets ohne direkte Targets gelten als indirekt. Anschließend wurde eine funktionelle Anreicherungsanalyse durchgeführt, um die molekularen Wirkmechanismen der Behandlungstargets zu ergründen. Die Resultate mittels NP-TCMtarget zeigten 1.604 Wirkungstargets und 816 strukturelle Targets für die Behandlung von Pneumonie mit Ma Xing Shi Gan Tang, wobei der Effekt über 164 direkte und 1.440 indirekte Targets erfolgt. Die Funktionalanalyse der 1.604 Wirkungstargets zeigte signifikante Anreicherung in 19 Signalwegen, und eine umfassende Analyse dieser Wege zeigt, dass Ma Xing Shi Gan Tang hauptsächlich durch Regulation der Zytokin-Zytokin-Rezeptor-Wechselwirkung, NF-κB Signalweg und Differenzierung der Helfer-T-Zelle 17 (Th17)-immunentzündlichen Signalwege die Pneumonie verbessert. Fazit: Die Studie fokussiert auf die Hierarchie der Wirkung von Arzneimitteltargets und kombiniert strukturelle Daten von Ma Xing Shi Gan Tang mit Transkriptomdaten der Gruppen, um systematisch den Wirkungspfad Komponente-direktes Target-indirektes Target-biologische Wirkung für die Pneumoniebehandlung aufzudecken.

Schlüsselwort

Ma Xing Shi Gan Tang; Pneumonie; Targets; Transkriptom; Netzwerkpharmakologie

References

  1. 1.
    MARTIN-LOECHES I，TORRES A，NAGAVCI B，et al.ERS/ESICM/ESCMID/ALAT guidelines for the management of severe community-acquired pneumonia［J］.Intensive Care Med，2023，49（6）：615-632.
  2. 2.
    Anon.Prevention and Control of Infectious Atypical Pneumonia （SARS） in Beijing， 2003［EB/OL］.（2003-05-28）.［2024-11-11］..
  3. 3.
    World Health Organization.WHO Coronavirus （COVID-19） Dashboard［EB/OL］.（2023）［2024-11-11］..
  4. 4.
    LOZANO R，NAGHAVI M，FOREMAN K，et al.Global and regional mortality from 235 causes of death for 20 age groups in 1990 and 2010：A systematic analysis for the global Burden of disease study 2010［J］.Lancet，2012，380（9859）：2095-2128.
  5. 5.
    CAO X F，LIU Z H，LI X，et al.Analysis of medication rule of TCM programs for prevention and treatment of COVID-19 in all areas of China［J］.Beijing J Tradit Chin Med，2020，39（5）：418-422.
  6. 6.
    LIU L， ZHANG H Y.Pharmacological effects of Maxing Shigan decoction［J］.China J Drug Econ，2015，10（12）：16-17.
  7. 7.
    LI J，LU C，JIANG M，et al.Traditional Chinese medicine-based network pharmacology could lead to new multicompound drug discovery［J］.Evid Based Complement Alternat Med，2012，2012：149762.
  8. 8.
    LI X，LIU Z Q，LIAO J，et al.Network pharmacology approaches for research of traditional Chinese medicines［J］.Chin J Nat Med，2023，21（5）：323-332.
  9. 9.
    LI P，ZHANG H R，ZHANG W X，et al.TMNP：A transcriptome-based multi-scale network pharmacology platform for herbal medicine［J］.Brief Bioinform，2022，23（1）：bbab542.
  10. 10.
    LI P，ZHANG H R，ZHANG Y Y，et al.New model and application of traditional Chinese medicine target research based on global chemical and biological profile inference［J］.Chin Tradit Herb Drug，2023，54（6）：1986-1997.
  11. 11.
    WANG A Y，WANG Y D，PENG H Y，et al.NP-TCMtarget：A network pharmacology platform for exploring mechanisms of action of traditional Chinese medicine［EB/OL］.（2024-08-13）［2024-01-01］..
  12. 12.
    YANG Y F，ZHANG G P，GAO Y H，et al.Effect of Pudilan Xiaoyan oral liquid on acute lung injury rat induced by lipopolysaccharide［J］.Chin J Exp Tradit Med Form，2019，25（13）：55-59.
  13. 13.
    LI Q Q，BAI C，YANG R C，et al.Deciphering the pharmacological mechanisms of Maxing Shigan decoction against COVID-19 through integrating network pharmacology and experimental exploration［J］.Front Pharmacol，2020，11：581691.
  14. 14.
    YANG R C，LIU H，BAI C，et al.Chemical composition and pharmacological mechanism of Qingfei Paidu decoction and Ma Xing Shi Gan decoction against coronavirus disease 2019 （COVID-19）：In silico and experimental study［J］.Pharmacol Res，2020，157（prepublish）：104820.
  15. 15.
    DAI Q W，LIU Y，ZENG G G，et al.Study on mechanism of Linggan Wuwei Jiangxin decoction in treating acute lung injury［J］.Chin J Exp Tradit Med Form，2023，29（24）：95-10.
  16. 16.
    HUANG K X，FU T F，GLASS L M，et al.DeepPurpose：A deep learning library for drug-target interaction prediction［J］.Bioinformatics，2021，36（22/23）：5545-5547.
  17. 17.
    TAKADA Y K，YU J，SHIMODA M，et al.Integrin binding to the trimeric interface of CD40L plays a critical role in CD40/CD40L signaling［J］.J Immunol，2019，203（5）：1383-1391.
  18. 18.
    TAHERBHOY A M，HUANG O W，COCHRAN A G.BMI1-RING1B is an autoinhibited RING E3 ubiquitin ligase［J］.Nat Commun，2015，6：7621.
  19. 19.
    SANDOUK A，XU Z，BARUAH S，et al.GRB2 dimerization mediated by SH2 domain-swapping is critical for T cell signaling and cytokine production［J］.Sci Rep，2023，13（1）：3505.
  20. 20.
    LI Y X，YAN J.To explore the mechanism of Fuzheng Touxie Jiedu decoction in treating pseudomonas aeruginosa pneumonia based on network pharmacology and cell experiments［J］.Guid J Tradit Chin Med Pharm，2024，30（7）：32-38.
  21. 21.
    LI Q L，PENG J，ZHOU B H，et al.Effect and anti-inflammation mechanism of Huangqin Shegan decoction for pediatric pneumonia based on network pharmacology and experimental studies［J］.Cent South Pharm，2023，21（8）：2009-2015.
  22. 22.
    AN R.Network pharmacological analysis and experimental studyon the mechanism of Maxing Shigan decoctionin treating PA pneumonia［D］.Tianjin：Tianjin University of Traditional Chinese Medicine，2023.
  23. 23.
    XI T T.Clinical observation of Maxing Shigan decoctionin in the treatment of community-acquired pneumonia［J］.Nei Mongol J Tradit Chin Med，2024，43（7）：44-46.
  24. 24.
    GONG X，MOU F Z，WEEI D R，et al.The clinical characteristics and medication analysis of corona virus disease 2019［J］.World Chin Med，2020，15（6）：819-826.
  25. 25.
    HAN Y.Maxing Shigan decoctionin for the treatment of acute attack of chronic bronchitis clinical effect［J］.Chin J Mod Drug，2020，14（4）：197-198.
  26. 26.
    LIN H Y.Analysis of curative effect of Maxing Shigan decoctionin on acute pneumonia［J］.China Prac Med，2022，17（3）：175-177.
  27. 27.
    XIE Y Z，JI S L，ZHAN S F，et al.Literature analysis and trial sequential analysis of Maxing Shigan decoction in treatmentof acute exacerbation of chronic obstructive pulmonary disease［J］.Chin J Basic Med Tradit Chin Med，2022，28（6）：909-918.
  28. 28.
    DONG Z Y，TIAN M Y，YANG Y，et al.Exploration of material basis of "clearing excessive fire of liver-gallbladder" of bile-processed coptidis rhizoma based on UPLC-Q-TOF/MS metabolomics and molecular docking technology［J］.Chin J Exp Tradit Med Form，2023，29（23）：140-149.
  29. 29.
    WANG C D，WANG C，ZHANG J J，et al.Effect and mechanism f echinacea purpurea in the treatment of acute pneumonia by clearing lung heat［J］.World Chin Med，2024，19（11）：1577-1583.
  30. 30.
    ZHANG T，MA C，ZHANG Z，et al.NF-κB signaling in inflammation and cancer［J］.Med Comm，2021，2（4）：618-653.
  31. 31.
    JIANG P，ZHANG Y，RU B B，et al.Systematic investigation of cytokine signaling activity at the tissue and single-cell levels［J］.Nat Methods，2021，18（10）：1181-1191.
  32. 32.
    PRAGER I，WATZL C.Mechanisms of natural killer cell-mediated cellular cytotoxicity［J］.J Leukoc Biol，2019，105（6）：1319-1329.
  33. 33.
    DAMJANOVIC D，DIVANGAHI M，KUGATHASAN K，et al.Negative regulation of lung inflammation and immunopathology by TNF-α during acute influenza infection［J］.Am J Pathol，2011，179（6）：2963-2976.
  34. 34.
    ZHAO C L，HUANG J W，ZHANG L，et al.Respiratory virus infections and inflammatory cytokines in hospitalized patients with acute exacerbation of chronic obstructive pulmonary disease［J］.Chin J Tuberc Respir Dis，2018，41（12）：942-948.

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