Identifizierung von biologischen Biomarkern für den kupperten Tod in der Alzheimer-Krankheit basierend auf Bioinformatik und maschinellem Lernen und klinischer Validierung und Vorhersage potenzieller chinesischer Medizin
Das Ziel dieser Studie ist es, bioinformatische und maschinelle Lernmethoden zu verwenden, um biologische Biomarker für den Kupfertod bei der Alzheimer-Krankheit (AD) zu identifizieren und auf klinische Proben zu validieren und potenzielle chinesische Arzneimittel vorherzusagen. Die Methoden verwenden die integrierte Genexpressdatenbank (GEO), um Gene zu erhalten, die im AD-Gruppe gegenüber der Normalgruppe differentiell exprimiert werden, und mit den berichteten Kupfertodgenen zu schneiden, unterschiedlich exprimierte Kupfertod-Gene zu erhalten; Verwenden Sie maschinelle Lernmethoden, um zentrale Kupfertod-Gene der AD zu identifizieren. Sammeln peripherer Leukozyten von klinischen Patienten mit Alzheimer-Krankheit, Verwendung der Echtzeit-PCR-Technik (Real-Time-PCR) zur klinischen Validierung der relativen Genexpressionsebene. Vorhersage potenzieller chinesischer Arzneimittel zur Regulierung des Kupfertodes, die die Alzheimer-Krankheit mit der COREMINE-Datenbank behandeln. Ergebnisse Es wurden insgesamt 12 mit dem Kupfertod verbundene Biomarker erhalten, die hauptsächlich am tricarbonsäurezyklus, am 2-Oxo-Säurestoffwechsel und am Kohlenstoffstoffwechsel der Wege beteiligt sind. Verwenden von 4 maschinellen Methoden, um schließlich 5 zentrale Gene auszuwählen, Dihydroliponamiddeshydrogenase (DLD), Glutaminase (GLS), Unterstützung E1 der Pyruvatdehydrogenase β (PDHB), Kernfaktor (erythrozytenabgeleiteter) Faktor zugehöriger Faktor 2 (NFE2L2) und E2-Untereinheit der Dihydroliponamid verzweigte Deshydrogenase (DBT). Klinisch sammeln normale Gruppe und Alzheimer-Patienten jeweils 30 Fälle, im Vergleich zur normalen Gruppe zeigte die AD-Gruppe eine signifikante Abnahme des MMSE (Mini-Mental State Examination) und des MoCA (Montreal Cognitive Assessment) (P < 0,01), Homocystein (Hcy), Interleukin-6 (IL-6), C-reaktives Protein (CRP), Amyloid-β (Aβ) zeigten eine signifikante Zunahme (P < 0,01), die Methode (MDA) zeigte eine signifikante Abnahme (P < 0,01) Die SOD-Enzymbetagung (SOD) zeigte eine signifikante Abnahme (P < 0,01) Die relative mRNA-Expressionsebene von NFE2L2 und DBT wurde aufwärts reguliert (P < 0,05), DLD, GLS, Die relative mRNA-Expressionsebene von PDHB zeigte eine signifikante Abnahme (P < 0,01). Regulierung des Kupfertodes bei der Alzheimer-Krankheit Behandlung von chinesischen Arzneimitteln Überwiegend heiß, flach, kalt und fünf Geschmack, Rückkehr zur Leber, Milz, Magen, Nierenleitung, mit hauptsächlichem Effekt, um den Haupt-Phlegm zu unterdrücken. Fazit DLD, GLS, NFE2L2, PDHB und DBT können als neue molekulare Diagnosemarkern für den mit dem Kupfertod verbundenen krankheits der Alzheimer-Krankheit dienen, die potenziellen Behandlungsmethoden der Alzheimer-Krankheit können neue Ideen für die Behandlung von chinesischer Medizin liefern.
关键词
Alzheimer-Krankheit; sterben von Kupfer; Bioinformatik; maschinelles Lernen; chinesische Medizin Vorhersage