Analyse de la diversité génétique de Pinellia basée sur les caractères phénotypiques et les marqueurs SSR et construction d'identity moléculaire

XU Yike ,  

LI Shuang ,  

KOU Peiwen ,  

LIU Changle ,  

SUN Xiaochun ,  

HUANG Wenjing ,  

摘要

L'objectif de l'étude est d'examiner la diversité génétique inter-germplasm de Pinellia, d'analyser les relations phylogénétiques entre les germplasmes, afin de fournir une base pour l'identification des germplasmes de Pinellia, la sélection variétale et la conservation des ressources. Méthodes : 27 échantillons de Pinellia ont été utilisés comme matériel expérimental, avec la mesure de 7 caractères phénotypiques dont la hauteur de la plante, la longueur et la largeur des feuilles. Des amorces SSR (Simple Sequence Repeat) ont été conçues à partir des données transcriptomiques, et une amplification PCR a été réalisée sur les 27 échantillons. Les logiciels POPGENE32, PowerMarker V3.25 et NTSYS-PC 2.10e ont été utilisés pour analyser la diversité génétique des germplasmes. Résultats : 10 amorces hautement polymorphes (PIC > 0,5) et 4 amorces modérément polymorphes (0,25 < PIC < 0,5) ont été sélectionnées. Le nombre moyen d'allèles détectés était 3,9286, les indices moyens de diversité de Nei (H) et de Shannon (I) étaient respectivement de 0,5578 et 1,0029, indiquant un haut niveau de diversité génétique. L'analyse de regroupement a divisé les germplasmes en 7 sous-classes, avec des germplasmes de la même province regroupés dans la même sous-classe. Quatorze amorces ont permis la construction d'une identité moléculaire SSR pour 27 germplasmes, réalisant ainsi une identification rapide de chaque région. Conclusion : les résultats posent une base pour de futures études sur la diversité génétique et la structure des populations de Pinellia, et fournissent une base scientifique pour l'identification des ressources, la construction de cartes et le sélection assistée par marqueurs moléculaires.

关键词

Pinellia ; marqueurs moléculaires à répétition simple (SSR) ; diversité génétique ; identité moléculaire

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