Identification des biomarqueurs biologiques associés à la mort du cuivre dans la maladie d'Alzheimer et validation clinique et prédiction potentielle de la médecine chinoise basée sur la bioinformatique et l'apprentissage automatique
L'objectif de cette étude est d'utiliser des méthodes de bioinformatique et d'apprentissage automatique pour identifier les biomarqueurs biologiques associés à la mort du cuivre dans la maladie d'Alzheimer (AD) et de les valider et prédire des médicaments chinois potentiels au niveau des échantillons cliniques. Les méthodes utilisent la base de données d'expression génique intégrée (GEO) pour obtenir des gènes exprimés de manière différentielle dans le groupe AD par rapport au groupe normal, intersectent avec les gènes de mort du cuivre rapportés, obtenir les gènes de mort du cuivre exprimés différemment; appliquer des méthodes d'apprentissage automatique pour identifier les gènes de mort du cuivre centraux de l'AD. Collecte de leuconucléides périphériques de patients cliniques atteints de la maladie d'Alzheimer, utilisation de la technique de réaction en chaîne de polymérase quantitative en temps réel (PCR en temps réel) pour valider cliniquement les niveaux d'expression relative des gènes. Prédire des médicaments chinois potentiels pour réguler la mort par cuivre traitant la maladie d'Alzheimer à l'aide de la base de données COREMINE. Résultats Un total de 12 biomarqueurs associés à la mort du cuivre a été obtenu, principalement impliqué dans le cycle de l'acide tricarboxylique, le métabolisme des acides 2-oxo et le métabolisme du carbone des itinéraires. Utilisation de 4 méthodes de machine pour finalement sélectionner 5 gènes centraux, dihydrolipoamide déshydrogénase (DLD), glutaminase (GLS), sous-unité E1 de la pyruvate déshydrogénase β (PDHB), facteur nucléaire (dérivé de globules rouges 2) facteur associé 2 (NFE2L2) et E2 sous-unité de la déshydrogénase branchée du dihydrolipoamide (DBT). Cliniquement collecter 30 cas de groupe normal et de patients atteints de la maladie d'Alzheimer, par rapport au groupe normal, le groupe AD a montré une diminution significative du mini-examenné mental de l'état pleuré (MMSE) et du monteur évaluant l'échelle cognitive Montré (MoCA) (P < 0,01), L'homocystéine (Hcy), l'interleukine-6 (IL-6), la protéine C-réactive (CRP), l'amyloïde-β (Aβ) a montré une augmentation significative (P < 0,01), la méthode d'induction (MDA) a montré une diminution significative (P < 0,01), Les niveaux d'enzyme de désintégration superoxyde (SOD) on montré une diminution significative (P < 0,01), L'expression relative de l'ARNm NFE2L2 et DBT a été régulée vers le haut (P < 0,05), DLD, GLS, L'expression relative de l'ARNm PDHB a montré une diminution significative (P < 0,01). La régulation des médicaments chinois pour le traitement de l'AD du gêne de la mort du cuivre principalement à chaud, à plat, à froid et à cinq goûts, retourne au foie, à la rate, à l'estomac, à l'inscription, avec l'efficacité de supprimer la phélicité phlegmonique principale. Conclusion DLD, GLS, NFE2L2, PDHB et DBT peuvent servir de nouveaux marqueurs moléculaires de diagnostic associés à la mort du cuivre dans la maladie d'Alzheimer, les médicaments potentiels pour le traitement de la maladie d'Alzheimer peuvent fournir de nouvelles idées pour le traitement de la médecine chinoise.
关键词
Maladie d'Alzheimer; mort du cuivre; bioinformatique; machine learning; médecine chinoise prédiction