Целью является объединение структур компонентов настоя Машин Сига Тан и данных транскриптома для систематического изучения молекулярного механизма лечения пневмонии на уровне мишеней. Метод использует модель системной сетевой фармакологии NP-TCMtarget с акцентом на лекарственные мишени, разработанную ранее нашей командой, для выявления эффектных мишеней настоя Машин Сига Тан для лечения пневмонии на основе данных транскриптома группы настоя и модели пневмонии, а также прогнозирования структурных мишеней на основе структурной информации компонентов настоя. Пересечение эффектных и структурных мишеней выявляет прямые мишени лечения пневмонии настоем, оставшиеся эффектные мишени без прямых считаются косвенными. Далее проведён функциональный анализ концентрации для изучения молекулярных механизмов действия мишеней. Результаты с использованием метода NP-TCMtarget обнаружили 1604 эффектные мишени и 816 структурных мишеней настоя Машин Сига Тан для лечения пневмонии, показали функционирование через 164 прямых и 1440 косвенных мишеней. Функциональный анализ 1604 эффектных мишеней выявил значительное обогащение в 19 путях; комплексный анализ этих путей показал, что настой в основном улучшает пневмонию через регуляцию взаимодействия цитокинов и их рецепторов, пути NF-κB и дифференцировку Т-хелперов 17 (Th17), связанных с иммунным воспалением. Заключение: данное исследование акцентирует внимание на уровнях действия лекарственных мишеней, сочетая структурные данные настоя с транскриптомными данными обеих групп, системно раскрывая путь действия компонентов – прямые мишени – косвенные мишени – биологические эффекты настоя Машин Сига Тан в лечении пневмонии.

Машин Сига Тан;пневмония;мишени;транскриптом;сетевая фармакология