Análisis de la diversidad genética de Pinellia basado en caracteres fenotípicos y marcadores SSR y construcción de identidad molecular

XU Yike ,  

LI Shuang ,  

KOU Peiwen ,  

LIU Changle ,  

SUN Xiaochun ,  

HUANG Wenjing ,  

摘要

El objetivo del estudio es investigar la diversidad genética entre el germoplasma de Pinellia y analizar las relaciones filogenéticas entre los germoplasmas, proporcionando una base para la identificación del germoplasma de Pinellia, la selección de variedades y la conservación de recursos. Método: se utilizaron 27 muestras de Pinellia como material experimental, midiendo 7 rasgos fenotípicos incluyendo altura de la planta, longitud y ancho de hoja. Se desarrollaron cebadores de secuencia de repetición simple (SSR) basados en datos del transcriptoma de Pinellia, y se realizó la amplificación por reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para las 27 muestras. Los programas POPGENE32, PowerMarker V3.25 y NTSYS-PC 2.10e se usaron para analizar la diversidad genética. Resultados: se seleccionaron 10 cebadores altamente polimórficos (PIC > 0.5) y 4 cebadores moderadamente polimórficos (0.25 < PIC < 0.5). El número promedio de alelos detectados fue 3.9286, los índices promedio de diversidad de Nei (H) y Shannon (I) fueron 0.5578 y 1.0029 respectivamente, mostrando un alto nivel de diversidad genética. El análisis de agrupamiento dividió el germoplasma en 7 subclases, con germoplasma de la misma provincia agrupados en la misma subclase. Se construyó la identidad molecular SSR de 27 muestras utilizando 14 cebadores, logrando la identificación rápida para cada región. Conclusión: los resultados proporcionan una base para futuros estudios sobre la diversidad genética y la estructura poblacional de Pinellia, así como para la identificación de recursos, construcción de mapas y mejoramiento asistido por marcadores moleculares.

关键词

Pinellia; marcadores moleculares de secuencia de repetición simple (SSR); diversidad genética; identidad molecular

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