El objetivo de este estudio es explorar el mecanismo de acción del Huangqi Chifeng Tang (HQCFT) en la aterosclerosis (AS) en ratas basado en la regulación de la flora intestinal y sus metabolitos. Métodos: Se construyó un modelo de ratas AS combinando una dieta alta en grasas y inyecciones de vitamina D3 durante 12 semanas. Cincuenta ratas macho SD de 8 semanas se asignaron al azar a cinco grupos: grupo de control, grupo de modelo, grupo de baja dosis de HQCFT (1,53 g·kg-1), grupo de alta dosis de HQCFT (3,06 g·kg-1), grupo de tabletas de calcio de atorvastatina (grupo Ato, 1,8 mg·kg-1), con 10 ratas por grupo. La administración gástrica comenzó al día siguiente de la modelización y se administró una vez al día durante 4 semanas. La eficacia del HQCFT se confirmó mediante tinción con Hematoxilina-Eosina (HE) de las arterias, niveles de lípidos sanguíneos y pruebas de reología sanguínea. Los niveles de expresión génica de factores inflamatorios en las arterias se detectaron mediante PCR en tiempo real. Se realizó un análisis de la composición de la flora intestinal, los niveles de ácidos grasos de cadena corta y el espectro de metabolitos de los contenidos intestinales mediante secuenciación de alto rendimiento, metabolómica dirigida y no dirigida. Resultados: En comparación con el grupo de control, el grupo de modelo mostró lesiones AS evidentes en los tejidos arteriales, incluyendo lesiones endoteliales, infiltración inflamatoria, formación de placas fibrosas y calcificadas, un aumento significativo en los niveles séricos de triglicéridos (TG), colesterol total (TC) y lipoproteínas de baja densidad (LDL-C) (P <0,05), y una disminución significativa en los niveles de lipoproteínas de alta densidad (HDL-C) (P <0,05), un aumento significativo en la viscosidad sanguínea total y en el plasma (P <0,05), un aumento significativo en los niveles de expresión de ARN mensajero de NLRP3, caspasa-1, interleucina (IL)-β, IL-6 y factor de necrosis tumoral-α (TNF-α) (P <0,05), cambios significativos en la composición de la flora intestinal, niveles de ácidos grasos de cadena corta y espectro de metabolitos de los contenidos intestinales. En comparación con el grupo de modelo, los niveles séricos de TC, TG y LDL-C fueron significativamente reducidos en los grupos de dosis de HQCFT (P <0,05) ; la viscosidad sanguínea total y del plasma fue significativamente reducida (P <0,05) ; los niveles de expresión de ARN mensajero de NLRP3 y los niveles de expresión de ARN mensajero de caspasa-1, IL-β, IL-6 y TNF-α fueron significativamente reducidos en los grupos de dosis de HQCFT (P <0,05) ; el HQCFT revirtió el aumento de la relación F/B, restableció la abundancia relativa reducida de Fusobacterium y la abundancia relativa aumentada de Desulfovibrio ; el HQCFT promovió la producción de acetato, butirato y propionato ; la metabolómica no dirigida identificó 39 metabolitos diferentes, principalmente enriquecidos en el metabolismo del ácido araquidónico y en la biosíntesis primaria de los ácidos biliares. Conclusiones: El mecanismo por el cual el HQCFT mejora las lesiones AS podría estar relacionado con cambios en la composición de la flora intestinal, la promoción de la producción de ácidos grasos de cadena corta y la regulación de los niveles de metabolitos intestinales, mejorando así las disrupciones metabólicas de los lípidos sanguíneos y la respuesta inflamatoria del organismo.