Revelando el mecanismo molecular de la decocción Ma Xing Shi Gan para tratar la neumonía basado en datos transcriptómicos y estructurales de la medicina tradicional china

WANG Yingdong ,  

PENG Haoyang ,  

WANG Aoyi ,  

ZHANG Wuxia ,  

BAI Chen ,  

LI Peng ,  

摘要

El objetivo es combinar la estructura de los componentes de la decocción Ma Xing Shi Gan y los datos de transcriptoma para explorar sistemáticamente el mecanismo molecular del tratamiento de la neumonía a nivel de los objetivos. El método utiliza el modelo de farmacología de redes sistémicas NP-TCMtarget, centrado en los objetivos de los fármacos, desarrollado previamente por nuestro equipo, para extraer los objetivos de efecto de la decocción Ma Xing Shi Gan para tratar la neumonía basándose en los datos de transcriptoma del grupo de la decocción y del modelo de neumonía, y para predecir los objetivos estructurales basados en la información estructural de los componentes. La intersección entre los objetivos de efecto y los objetivos estructurales revela los objetivos directos del tratamiento, mientras que los objetivos de efecto restantes sin objetivos directos se consideran objetivos indirectos. Se realizó un análisis funcional enriquecido para interpretar los mecanismos moleculares de las dianas terapéuticas. Los resultados, utilizando el método NP-TCMtarget, identificaron 1,604 objetivos de efecto y 816 objetivos estructurales de la decocción Ma Xing Shi Gan para tratar la neumonía, mostrando que actúa mediante 164 objetivos directos y 1,440 objetivos indirectos. El análisis funcional de los 1,604 objetivos de efecto mostró un enriquecimiento significativo en 19 vías, y un análisis integral de estas vías mostró que la decocción actúa principalmente regulando la interacción citocina-receptor, la vía de señal NF-κB y la diferenciación de células T auxiliares 17 (Th17) relacionadas con la inflamación inmunológica para mejorar la neumonía. En conclusión, este estudio se centra en la jerarquía de acción de los objetivos farmacológicos, combinando los datos estructurales y transcriptómicos del grupo de la decocción y del modelo de neumonía, revelando sistemáticamente la ruta de acción compuesto-objetivo directo-objetivo indirecto-efecto biológico de la decocción Ma Xing Shi Gan en el tratamiento de la neumonía.

关键词

Ma Xing Shi Gan; neumonía; objetivos; transcriptoma; farmacología de redes

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