El objetivo es cortar la sopa de calentamiento de yang utilizando la tecnología de secuenciación 5-hmC-Seal y la farmacología de red para mejorar la eficacia del tratamiento de la nefropatía diabética (ND) con la sopa de calentamiento de yang y explorar nuevos métodos de desarrollo de nuevas fórmulas herbales chinas. Métodos: Recopilamos 14 pacientes diabéticos (DM) y 15 pacientes con ND hospitalizados en el departamento de endocrinología del Hospital de la Universidad de Pekín en 2021. Secuenciamos ADN libre circulante (cfDNA) en el plasma de los pacientes, utilizamos un análisis de agrupación temporal para procesar y seleccionar los datos de secuenciación, utilizamos un análisis de validación cruzada del conjunto de genes ND de la base de datos para obtener el conjunto de genes ND. Buscamos los genes diana de 7 ingredientes de hierbas en la sopa de calentamiento de yang en la base de datos y plataforma de análisis farmacológico de medicina china (TCMSP) y la Enciclopedia de Medicina Tradicional China (ETCM), y cruzamos el análisis entre los conjuntos de genes ND para buscar genes comunes de la enfermedad y componentes de hierbas medicinales. Construimos una red de interacción proteína-proteína (PPI) seleccionando genes clave y buscando hierbas medicinales parasitadas por genes clave en la base de datos ETCM, y eliminamos las hierbas medicinales que pueden ser eliminadas. Luego realizamos un análisis de enriquecimiento KEGG de genes ND no intersectoriales, seleccionamos genes clave en vías relacionadas con ND mediante aprendizaje automático, y validamos la tendencia de expresión de genes modificados 5-hmC y la viabilidad de los genes diana como dianas utilizando el conjunto de datos GSE30529. Buscamos los genes diana en la base de datos del banco de recursos de medicina tradicional china (TCMBank) y establecimos una red clave-cómpuestos de hierbas medicinales-medicina tradicional china utilizando la tecnología de acoplamiento molecular para verificar la actividad de unión de compuestos con las claves. Buscamos hierbas medicinales candidatas que apuntan a los genes relacionados con ND en las bases de datos TCMSP y ETCM y contamos el número, seleccionamos hierbas medicinales candidatas y las combinamos para formar una nueva fórmula. Luego validamos la eficacia de la nueva fórmula con un modelo de ratón ND, medimos la masa corporal de los ratones, la glucosa aleatoria, la albúmina urinaria microscópica (mALB), la creatinina sérica (SCr), el nitrógeno ureico en sangre (BUN), la tinción de hematoxilina y eosina (HE), la tinción de PAS, la tinción de tricromo de Masson, la inmunofluorescencia y la reacción de amplificación en cadena en tiempo real (PCR en tiempo real). Resultados: El análisis cruzado de los resultados mostró que el conjunto de genes ND incluía 507 genes, de los cuales 30 eran genes diana de la sopa de calentamiento de yang. Los resultados del análisis PPI mostraron que el 15% de los genes diana contribuyentes (grado) eran la interleucina-6 (IL-6), el receptor de tipo Toll (TLR4), la lactoferrina (LTF), la lipoproteína lipasa (LPL), el factor de transcripción ligado al elemento regulador de esteroides 1 (SREBF1), el hueso de melocotón y la lagartija en la sopa de calentamiento de yang no estaban relacionados con los genes clave y fueron eliminados. Mediante aprendizaje automático, seleccionamos 10 genes diana potenciales, entre los que la tendencia de expresión del dominio 5 de la familia del dominio TBC1 (TBC1D5), el homólogo B de la vía menor de recombinación del ADN RAD51 (RAD51B) y la subunidad de la alfa 6 del proteasoma 20S (PSMA6) fue coherente con el conjunto de datos GSE30529 y podría ser utilizado como diana de medicamentos. Los resultados de la red clave-cómpuestos de hierbas medicinales-medicina tradicional china y la tecnología de acoplamiento molecular mostraron que los compuestos que se unieron bien a las proteínas clave fueron la arginina, la glicina, el aceite de nuez moscada, la serina y la tirosina, corresponden a 121 medicamentos. El número de medicinas candidatas que apuntan a los genes DN fue más alto para el licio, el ginseng, el ñame, la rehmannia preparada, la raíz de belenio, el ginseng dangshen, el ophipogon, el ajo, la hoja de carya y la pulmonaria, combinando con la teoría de la medicina tradicional china, eliminamos el hueso de melocotón y la lagartija de la fórmula original de la sopa de calentamiento de yang, agregamos rehmannia y ñame, los resultados del experimento animal mostraron que la sopa de calentamiento de yang con adiciones y eliminaciones puede mejorar la función renal de los ratones ND (P<0.05) e inhibir la fibrosis renal (P<0.05), y el efecto es mejor que la fórmula original (P<0.05). Conclusión: Cortar la sopa de calentamiento de yang utilizando la tecnología de secuenciación 5-hmC-Seal, la sopa de calentamiento de yang con adiciones y eliminaciones tiene un mejor efecto de inhibición de la fibrosis y mejora de ND en comparación con la fórmula original, lo que explica la teoría biomédica detrás del desarrollo de fórmulas herbales chinas basadas en la epigenética y puede proporcionar nuevas ideas para la investigación de fórmulas herbales chinas.

Nefropatía diabética; 5-hidroximetilcitosina (5-hmC); sopa de calentamiento de yang; medicina china