Identificación de biomarcadores biológicos asociados con la muerte del cobre en la enfermedad de Alzheimer y validación clínica y predicción potencial de medicina china basada en bioinformática y aprendizaje automático
El objetivo de este estudio es utilizar métodos de bioinformática y aprendizaje automático para identificar biomarcadores biológicos asociados a la muerte del cobre en la enfermedad de Alzheimer (AD) y validar y predecir posibles medicamentos chinos a nivel de muestras clínicas. Los métodos utilizan la base de datos integrada de expresión génica (GEO) para obtener genes expresados de manera diferencial en el grupo AD en comparación con el grupo normal, intersectar con los genes de muerte del cobre informados, obtener los genes de muerte del cobre expresados de manera diferente; aplicar métodos de aprendizaje automático para identificar los genes centrales de muerte del cobre de la AD. Recolección de leucocitos periféricos de pacientes clínicos con enfermedad de Alzheimer, uso de la técnica de reacción en cadena de polimerasa cuantitativa en tiempo real (PCR en tiempo real) para validar clínicamente los niveles de expresión relativa de los genes. Predecir posibles medicamentos chinos para regular la muerte por cobre que trata la enfermedad de Alzheimer utilizando la base de datos COREMINE. Resultados Se obtuvo un total de 12 biomarcadores asociados con la muerte del cobre, principalmente involucrados en el ciclo del ácido tricarboxílico, el metabolismo de ácidos 2-oxo y el metabolismo del carbono de las rutas. Uso de 4 métodos de máquina para finalmente seleccionar 5 genes centrales, dihidrolipamida deshidrogenasa (DLD), glutaminasa (GLS), subunidad E1 de la piruvato deshidrogenasa β (PDHB), factor nuclear (derivado de eritrocitos 2) factor asociado 2 (NFE2L2) y E2 subunidad de la deshidrogenasa ramificada dihidrolipamida (DBT). Clínicamente recoger 30 casos de grupo normal y pacientes con enfermedad de Alzheimer, en comparación con el grupo normal, el grupo de Alzheimer mostró una disminución significativa en la prueba de estado mental mini (MMSE) y en la prueba de evaluación cognitiva de Montreal (MoCA) (P < 0.01), La homocisteína (Hcy), la interleucina-6 (IL-6), la proteína C reactiva (PCR), la amiloide-β (Aβ) mostraron un aumento significativo (P < 0.01), el método de inducción (MDA) mostró una disminución significativa (P < 0.01), Los niveles de enzima superóxido dismutasa (SOD) mostraron una disminución significativa (P < 0.01), La expresión relativa del ARNm NFE2L2 y DBT se reguló al alza (P < 0.05), DLD, GLS, La expresión relativa del ARNm PDHB mostró una disminución significativa (P < 0.01). La regulación de medicamentos chinos para tratar la AD por la muerte del cobre principalmente a caliente, plano, frío y cinco sabores, regrese al hígado, bazo, estómago, inscripción, con la eficacia principal para suprimir la phlegm conjure. Conclusión DLD, GLS, NFE2L2, PDHB y DBT pueden servir como nuevos biomarcadores moleculares de diagnóstico asociados con la muerte del cobre en la enfermedad de Alzheimer, los posibles medicamentos para tratar la enfermedad de Alzheimer pueden proporcionar nuevas ideas para el tratamiento de la medicina china.
关键词
Enfermedad de Alzheimer; muerte del cobre; bioinformática; aprendizaje automático; predicción de medicina china