西伯利亚蓼EST-SSR引物开发和国内资源的遗传背景分析

王晓云; 徐旭; 程波翔; 慕泽泾; 杜小浪; 钟国跃

doi:10.13422/j.cnki.syfjx.2018050043

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西伯利亚蓼EST-SSR引物开发和国内资源的遗传背景分析

资源与鉴定 | 更新时间：2024-01-04

- 西伯利亚蓼EST-SSR引物开发和国内资源的遗传背景分析
- Development of EST-SSR Markers and Genetic Background Analysis for in China
- 中国实验方剂学杂志 2018年24卷第5期页码：43-49
- 作者机构：
- 作者简介：
- 基金信息：
  
  江西民族传统药现代科技与产业发展协同创新中心2014年度协同创新项目（JXXT201401007）
- DOI：10.13422/j.cnki.syfjx.2018050043
  中图分类号： S567.239
- 纸质出版日期：2018
- 稿件说明：
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王晓云, 徐旭, 程波翔, 等. 西伯利亚蓼EST-SSR引物开发和国内资源的遗传背景分析[J]. 中国实验方剂学杂志, 2018,24(5):43-49.

WANG Xiao-yun, XU Xu, CHENG Bo-xiang, et al. Development of EST-SSR Markers and Genetic Background Analysis for in China[J]. Chinese journal of experimental traditional medical formulae, 2018, 24(5): 43-49.
王晓云, 徐旭, 程波翔, 等. 西伯利亚蓼EST-SSR引物开发和国内资源的遗传背景分析[J]. 中国实验方剂学杂志, 2018,24(5):43-49. DOI： 10.13422/j.cnki.syfjx.2018050043.

WANG Xiao-yun, XU Xu, CHENG Bo-xiang, et al. Development of EST-SSR Markers and Genetic Background Analysis for in China[J]. Chinese journal of experimental traditional medical formulae, 2018, 24(5): 43-49. DOI： 10.13422/j.cnki.syfjx.2018050043.

摘要

目的：评价国内西伯利亚蓼资源的遗传分化程度，为种群分化、物种进化、资源保护和药材品质保障提供科学依据。方法：从国内4个省份13个采样点采集56份西伯利亚蓼，开发并筛选多态性EST-SSR标记，结合相关序列扩增多态性（SRAP）分子标记扩增结果，通过计算遗传距离和聚类分析，评价不同生态分布区域内西伯利亚蓼的遗传分化程度。结果：开发的45对EST-SSR引物中，38对引物有扩增产物，共扩增出660个条带，其中17对引物产生的多态性条带比率为100%，共扩增出多态性条带303条。96对SRAP通用引物中，67对引物有扩增产物，共扩增出1 347个条带，其中58对引物产生的多态性条带比率为100%，共扩增出多态性条带1 147条。种群遗传距离计算和聚类分析结果表明，西伯利亚蓼种群内和种群间均有遗传分化，分布区域相隔越远，遗传分化程度越高。结论：地理位置隔离、海拔高度均影响了国内西伯利亚蓼种质资源的分布和分化，人类活动可能也对其有影响。

Abstract

Objective:To explore the genetic differentiationof Polygonum sibiricum in different areas in China

in order toprovide basis for its population subdivision

evolution

protection and utilization

and quality control. Method:Fiftysix samples were collected from 13 sampling sites in four provinces of China. EST-SSR primers were developed and screened

and the genetic differentiation was evaluated with both EST-SSR and sequence related amplified polymorphism(SRAP) markers. Result:Among 45 pairs of EST-SSR primers

38 pairs amplified 660 distinguished bands

and 17 pairs amplified 303 polymorphic bands

with a polymorphism rate of 100%. Among 96 pairs of SRAP primers

67 pairs amplified 1 347 distinguished bands

and 58 pairs amplified 1 147 polymorphic bands

with a polymorphism rate of 100%. Genetic distance and cluster analysis revealed both inter-and inner-population have genetic differentiation. Conclusion:Genetic variation and geographic differentiation areobserved among P. sibiricum populations in China

which were affected by geographic distances

altitudes and possibly mankind activities.

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