中药地枫皮及其伪品假地枫皮的DNA条形码鉴定

叶晓霞; 王小敏; 陈善兰; 赵仕花; 吴仕蔓; 杨玲

doi:10.13422/j.cnki.syfjx.20191511

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中药地枫皮及其伪品假地枫皮的DNA条形码鉴定

资源与质量评价 | 更新时间：2021-02-09

- 中药地枫皮及其伪品假地枫皮的DNA条形码鉴定
- Identification of Illicium difengpi and Its Fake I. jiadifengpi Using DNA Barcoding
- 中国实验方剂学杂志 2019年25卷第15期页码：185-190
- 作者机构：
  
  1.玉林师范学院，广西　玉林　 537000；
  2.钦州合浦师范学校，广西　钦州　 535000
- 作者简介：
  
  叶晓霞，硕士，讲师，主要从事植物分类学及资源学研究，Tel：0775-2679937，E-mail: yexiaoxia1015@163.com
- 基金信息：
  
  广西高校科研项目(KY2015YB245);玉林师范学院高等教育本科教学改革工程项目(2018XJJG38)
- DOI：10.13422/j.cnki.syfjx.20191511
  中图分类号： R284.2; R289; R22; R2-031
- 收稿日期：2019-04-02，
  
  网络出版日期：2019-04-08，
  
  纸质出版日期：2019-08-05
- 稿件说明：
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叶晓霞, 王小敏, 陈善兰, 等. 中药地枫皮及其伪品假地枫皮的DNA条形码鉴定[J]. 中国实验方剂学杂志, 2019,25(15):185-190.

Xiao-xia YE, Xiao-min WANG, Shan-lan CHEN, et al. Identification of Illicium difengpi and Its Fake I. jiadifengpi Using DNA Barcoding[J]. Chinese journal of experimental traditional medical formulae, 2019, 25(15): 185-190.
叶晓霞, 王小敏, 陈善兰, 等. 中药地枫皮及其伪品假地枫皮的DNA条形码鉴定[J]. 中国实验方剂学杂志, 2019,25(15):185-190. DOI： 10.13422/j.cnki.syfjx.20191511.

Xiao-xia YE, Xiao-min WANG, Shan-lan CHEN, et al. Identification of Illicium difengpi and Its Fake I. jiadifengpi Using DNA Barcoding[J]. Chinese journal of experimental traditional medical formulae, 2019, 25(15): 185-190. DOI： 10.13422/j.cnki.syfjx.20191511.

摘要

目的：

评价和比较几个常用DNA条形码候选序列对地枫皮及伪品假地枫皮的鉴定作用。

方法：

采集不同产地的地枫皮及假地枫皮样品，进行总DNA提取，选取核基因内转录间隔区2(ITS2)序列、叶绿体

rbc

L，

mat

K基因序列进行聚合酶链式反应(PCR)扩增，纯化产物测序，利用CondonCode Aligner V3.7.1 校对拼接。

结果：

地枫皮及假地枫皮

rbc

L序列进行多次PCR扩增及测序结果均不理想，初步推测地枫皮及假地枫皮

rbc

L序列太长，进化较慢，不适合作为地枫皮及假地枫皮种间鉴别；地枫皮及假地枫皮的

mat

K基因序列测序成功率分别为0和76.8%，可能是不同类群的植物

mat

K序列的引物标准不一；对地枫皮及假地枫皮的ITS2序列PCR扩增及测序结果最为理想，测序的成功率分别为89.3%及91.2%，对测序结果序列进行分析，地枫皮的ITS2序列总长度均为268个碱基，存在2个变异位点；假地枫皮的ITS2序列总长度均为430个碱基，存在4个或3个变异位点。实验结果说明地枫皮及假地枫皮ITS2序列较短，有明显的变异性，便于扩增，表明ITS2序列用于地枫皮及假地枫皮的分子鉴定优于

rbc

L和

mat

K序列。

结论：

ITS2序列作为标准的DNA条形码能够有效地鉴定地枫皮及其伪品假地枫皮。

Abstract

Objective:

To evaluate and compare the identification of several DNA barcoding candidate sequences on

Illicium difengpi

and its fake

jiadifengpi

Method:

Samples from different origins of

difengpi

and

jiadifengpi

were collect extraction of total DNA

nuclear gene ITS2 sequence

chloroplast

rbc

mat

K gene sequence were selected for PCR amplification

product purification and sequencing

and CondonCode Aligner V3.7.1 was used to proofread stitching.

Result:

PCR amplification and sequencing of

rbc

L sequences of

difengpi

and

jiadifengpi

were not satisfactory. It is assumed that their

rbc

L sequences were too long with slow evolution

which was unsuitable for interbreeding. The success rate of

mat

K sequencing of

difengpi

and

jiadifengpi

was 0 and 76.8%

which may be because primer standards were different for

mat

K sequences of different groups. The results of PCR amplification and sequencing of ITS2 on

difengpi

and

jiadifengpi

were successful

with the success rate of sequencing was 89.3% and 91.2%. Analysis sequencing results

the total length of ITS2 sequences was 268 bases

and there were 2 variation sites of

difengpi

. The total length of ITS2 sequences was 430 bases

and there were 4 or 3 variation sites of

jiadifengpi

. It shows that ITS2 sequences of

difengpi

and

jiadifengpi

were short and has obvious variability and can be amplify

that ITS2 sequence was better than

rbc

L and

mat

K sequence in molecular identification of

difengpi

and

jiadifengpi

Conclusion:

DNA barcoding based on ITS2 sequence was a powerful and efficient tool for identification of

difengpi

and its fake

jiadifengpi

关键词

Keywords

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