基于AFLP分子标记的广藿香遗传多样性分析

刘晓莹; 李嘉惠; 杨钰婷; 严寒静; 张宏意; 何梦玲

doi:10.13422/j.cnki.syfjx.20202312

您当前的位置：

首页 >

文章列表页 >

基于AFLP分子标记的广藿香遗传多样性分析

药学基础 | 更新时间：2021-12-03

- 基于AFLP分子标记的广藿香遗传多样性分析
- Genetic Diversity Analysis of Pogostemon cablin Based on AFLP Markers
- 中国实验方剂学杂志 2021年27卷第4期页码：152-158
- 作者机构：
  
  广东药科大学中药学院，国家中医药管理局岭南药材生产与开发重点研究室，中药材国家现代农业产业技术体系广州综合试验站（CARS-21-16），广州 510006
- 作者简介：
  
  刘晓莹，在读硕士，从事药品食品分析与质量控制研究工作，E-mail：1552436667@qq.com
  * 何梦玲，博士，副教授，从事中药资源开发与品质评价研究工作，E-mail：hmldf@126.com
- 基金信息：
  
  广东省科技项目(2015A030302084;2017A030303082;2017A030303081);国家自然科学基金项目(81773829);广东省重点领域研发计划项目(2020B020221002);广东省中管局项目(20163010)
- DOI：10.13422/j.cnki.syfjx.20202312
  中图分类号： R284.2;R289;R22;R2-031
- 收稿日期：2020-04-04，
  
  网络出版日期：2020-10-22，
  
  纸质出版日期：2021-02-20
- 稿件说明：
移动端阅览
刘晓莹,李嘉惠,杨钰婷等.基于AFLP分子标记的广藿香遗传多样性分析[J].中国实验方剂学杂志,2021,27(04):152-158.

LIU Xiao-ying,LI Jia-hui,YANG Yu-ting,et al.Genetic Diversity Analysis of Pogostemon cablin Based on AFLP Markers[J].Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2021,27(04):152-158.
刘晓莹,李嘉惠,杨钰婷等.基于AFLP分子标记的广藿香遗传多样性分析[J].中国实验方剂学杂志,2021,27(04):152-158. DOI： 10.13422/j.cnki.syfjx.20202312.

LIU Xiao-ying,LI Jia-hui,YANG Yu-ting,et al.Genetic Diversity Analysis of Pogostemon cablin Based on AFLP Markers[J].Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2021,27(04):152-158. DOI： 10.13422/j.cnki.syfjx.20202312.

摘要

目的

采用扩增片段长度多态性（AFLP）分子标记方法研究广藿香的种质遗传多样性。

方法

采用12对引物对14个品种共212个样本进行AFLP分析；利用POPGENE 32，Arlequinver 3.5，MEGA7，NTSYSpc 2.10e等生物学分析软件进行多态性参数计算、主坐标分析以及聚类分析。

结果

12对引物共扩增出2 238个位点，其中多态性位点有2 226个，多态位点百分率为99.38%；在种群间，有效等位基因数（

）为1.365 6±0.066 3，Nei's基因多样性指数（

）为0.220 7±0.036 4，Shannon多态性信息指数（

）为0.343 7±0.050 2；在种群内，

为1.118 5±0.038 7，

为0.071 3±0.023 0，

为0.109 4±0.035 0；分子方差学分析（AMOVA）表明广藿香的总变异有71.57%来源于种群间，28.43%来源于种群内；聚类分析可将14个种群分为4大类。

结论

AFLP分子标记结果显示，广藿香种间具有比较丰富的遗传多样性，种内遗传多样性相对较小，种间遗传分化显著，可为广藿香后续的优良种质筛选等研究提供参考依据。

Abstract

Objective

This paper aims to study the genetic diversity of

Pogostemon cablin

by amplified fragment length polymorphism （AFLP） markers.

Method

The 12 pairs of primers were used for AFLP analysis of 212 samples from 14 varieties，and biological analysis software such as POPGENE 32，Arlequinver 3.5，MEGA 7 and NTSYSpc 2.10e were used for polymorphism parameter calculation，principal coordinate analysis and cluster analysis.

Result

A total of 2 238 loci were amplified by 12 pairs of primers. 2 226 of them were polymorphic loci， accounting for 99.38%. At the inter-population level，the values of effective alleles（

），Nei's gene diversity index（

），Shannon polymorphic information index（

） were 1.365 6±0.066 3， 0.220 7±0.036 4， and 0.343 7±0.050 2，respectively；and 1.118 5±0.038 7，0.071 3±0.023 0，0.109 4±0.035 0，respectively at the intra-population level. Analysis of molecular variance（AMOVA）showed that 71.57% of the total variation of

P. cablin

was of inter-population nature， and 28.43% was of intra-population nature. The 14 populations could be divided into four groups by cluster analysis.

Conclusion

The results of AFLP molecular markers showed that abundant genetic diversity was present at inter-population level of

P. cablin

，however，relatively low at intra-population level； the genetic differentiation at the inter-population level was significant，which could provide a reference for the subsequent study of good germplasm selection of

P. cablin

关键词

Keywords

references

国家药典委员会 . 中华人民共和国药典：一部［M］. 北京：中国医药科技出版社， 2015 ： 45 .

徐雯，吴艳清，丁浩然，等 . 广藿香的药理作用及机制研究进展［J］. 上海中医药杂志， 2017 ， 51 （ 10 ）： 103 - 106 .

吴卓娜，吴卫刚，张彤，等 . 不同产地广藿香化学成分及药理作用研究进展［J］. 世界科学技术—中医药现代化， 2019 ， 21 （ 6 ）： 1227 - 1231 .

贾旭玲，徐三，施芬 . 广藿香的研究进展［J］. 中华中医药学刊， 2010 ， 28 （ 11 ）： 2442 - 2444 .

罗集鹏，刘玉萍，冯毅凡，等 . 广藿香的两个化学型及产地与采收期对其挥发油成分的影响［J］. 药学学报， 2003 ， 38 （ 4 ）： 307 - 310 .

VOS P ， HOGERS R ， BLEEKER M . AFLP：a new technique for DNA finger printing ［J］. Nucleic Acids Res ， 1995 ， 23 （ 5 ）： 4407 - 4414 .

黄映萍 . DNA分子标记研究进展［J］. 中山大学研究生学刊：自然科学医学版， 2010 ， 31 （ 2 ）： 27 - 36 .

LI S F ， WANG L J ， DENG C L ， et al . Identification of male-specific AFLP and SCAR markers in the dioecious plant，Humulus scandens ［J］. Mol Cell Probe ， 2017 ， 34 ： 68 - 70 .

杜春华，普春霞，刘小莉，等 . 短柄乌头遗传多样性的AFLP分析［J］. 中草药， 2018 ， 49 （ 2 ）： 439 - 443 .

GAUDEUL M ， DELAHAYE T ， MULLER S . AFLP markers show low levels of clonal propagation and high genotypic diversity in the rare，southernmost populations of Linnaea borealis L.（Caprifoliaceae） in the Western Alps ［J］. Genetica ， 2019 ， 147 （ 1 ）： 79 - 90 .

叶晓霞，王小敏，陈善兰，等 . 中药地枫皮及其伪品假地枫皮的DNA条形码鉴定［J］. 中国实验方剂学杂志， 2019 ， 25 （ 15 ）： 185 - 190 .

蒲天珍，张秀桥，周佩娜，等 . 大叶蛇葡萄类纤维素合成酶基因的克隆及其序列分析［J］. 中国实验方剂学杂志， 2019 ， 25 （ 20 ）： 147 - 152 .

KEARSEY M J . Plant population genetics， breeding and genetic resources ［J］. Genet Res ， 1991 ， 58 （ 2 ）： 180 - 181 .

WRIGHT S . Evolution in Mendelian populations ［J］. Genetic ， 1931 ， 16 （ 2 ）： 97 - 159 .

吴友根 . 广藿香种质资源分子标记、栽培生理及其品质评价［D］. 南京：南京农业大学， 2009 .

ROHLF F J . NTSYSpc：Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System . Exeter Software ， Setauket ， New York .

胡珊，陈洪毅，邬龙怡，等 . DNA条形码及ISSR技术对广藿香种质资源的分析［J］. 现代中药研究与实践， 2019 ， 33 （ 1 ）： 8 - 11 .

胡贞贞，黄伟展，卢昌华，等 . 不同产地广藿香非靶向代谢组学研究［J］. 中药材， 2019 ， 42 （ 2 ）： 271 - 278 .

浏览量

下载量

CSCD

文章被引用时，请邮件提醒。

提交

工具集

关联资源

基于表型性状和SSR标记的半夏遗传多样性分析及分子身份证构建

野生与栽培中药材品质对比的研究进展与相关建议

经典名方中藿香类药材的本草考证

基于SSR分子标记的灯盏花遗传多样性分析

中药制剂质量与临床疗效的保障：中药品质传递过程控制