枯萎病对菊花根际土壤微生物群落结构的影响

陈巧环; 苗玉焕; 王铁霖; 郭兰萍; 刘大会

doi:10.13422/j.cnki.syfjx.20210713

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枯萎病对菊花根际土壤微生物群落结构的影响

药学基础 | 更新时间：2021-05-17

- 枯萎病对菊花根际土壤微生物群落结构的影响
- Fusarium Wilt Changes Microbial Community Structure in Rhizosphere Soil of Chrysanthemum morifolium
- 中国实验方剂学杂志 2021年27卷第11期页码：180-186
- 作者机构：
  
  1.湖北中医药大学药学院，武汉 430065
  2.中国中医科学院中药资源中心，北京 100700
- 作者简介：
  
  陈巧环，在读硕士，从事中药的品种、质量及资源开发研究，E-mail：1297716454@qq.com
  刘大会，教授，博士生导师，从事中药资源品质评价与开发研究，Tel：027-68890106，E-mail：liudahui@hbtcm.edu.cn
- 基金信息：
  
  中央本级重大增减支项目(2060302);现代农业产业技术体系项目(CARS-21);国家重点研发计划项目(2017YFC1700704;2018YFD0201107)
- DOI：10.13422/j.cnki.syfjx.20210713
  中图分类号： R284.2;R289;R22;R2-031;R33
- 收稿日期：2021-02-16，
  
  网络出版日期：2021-03-29，
  
  纸质出版日期：2021-06-05
- 稿件说明：
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陈巧环,苗玉焕,王铁霖等.枯萎病对菊花根际土壤微生物群落结构的影响[J].中国实验方剂学杂志,2021,27(11):180-186.

CHEN Qiao-huan,MIAO Yu-huan,WANG Tie-lin,et al.Fusarium Wilt Changes Microbial Community Structure in Rhizosphere Soil of Chrysanthemum morifolium[J].Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2021,27(11):180-186.
陈巧环,苗玉焕,王铁霖等.枯萎病对菊花根际土壤微生物群落结构的影响[J].中国实验方剂学杂志,2021,27(11):180-186. DOI： 10.13422/j.cnki.syfjx.20210713.

CHEN Qiao-huan,MIAO Yu-huan,WANG Tie-lin,et al.Fusarium Wilt Changes Microbial Community Structure in Rhizosphere Soil of Chrysanthemum morifolium[J].Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2021,27(11):180-186. DOI： 10.13422/j.cnki.syfjx.20210713.

摘要

目的

探究患枯萎病菊花与健康菊花根际土壤微生物群落的差异。

方法

以患病菊花植株和健康菊花植株根际土壤为研究材料，采用高通量测序技术对患病植株和健康植株样本的细菌16S rDNA和真菌内部转录间隔区（ITS）基因进行序列测定并进行数据分析。

结果

枯萎病的发生降低了菊花根际土壤中细菌种群的丰富度和多样性程度，但对根际土壤中的真菌

-多样性无明显影响。菊花健康植株根际土壤细菌微生物中酸杆菌门、芽单胞菌门、硝化螺旋菌门占比高于患病植株，而变形菌门、拟杆菌门占比低于患病植株（

0.05）。菊花患病植株根际土壤中镰刀菌属（

Fusarium

）真菌占比分别为27.49%，14.53%，11.94%，而健康植株镰刀菌属真菌占比分别为0.47%，1.01%，0.67%。菊花患病植株根际土壤中会出现细菌性致病菌果胶杆菌属（

Pectobacterium

）和菊迪基氏菌属（

Dickeya

），而健康植株根际土壤中硝化类细菌、解毒类细菌、光合细菌等丰度高于患病植株。

结论

患有枯萎病地块菊花植株根际土壤微生物中细菌的物种多样性和丰富度降低，并大量富集镰刀菌属致病真菌和积累果胶杆菌属与菊迪基氏菌属致病细菌，而健康菊花植株根际土壤微生物有益菌占比明显高于患病植株。

Abstract

Objective

To explore the differences in rhizosphere microbial community structure between

Fusarium

wilt-infected and healthy

Chrysanthemum morifolium

plants

Method

The rhizosphere soils of diseased and healthy

C. morifolium

plants were sampled and subjected to high-throughput 16S ribosomal DNA （rDNA） and internal transcribed spacer （ITS） sequencing， to identify the microbial community structure including bacteria and fungi.

Result

Fusarium

wilt reduced the bacterial abundance and diversity but had no significant effect on fungal alpha-diversity.The proportions of Acidobacteria， Gemmatimonadetes， and Nitrospirae in rhizosphere soil of healthy

C.morifolium

plants were higher than those of diseased plants， while the proportions of Proteobacteria and Bacteroidetes were lower（

0.05）.

Fusarium

fungi accounted for 27.49%， 14.53%， and 11.94% in diseased plants whereas 0.47%， 1.01%， and 0.67% in healthy plants.Pathogenic bacteria

Pectobacterium

and

Dickeya

were enriched in rhizosphere soil of diseased plants. The abundances of nitrifying， detoxifying， and photosynthetic bacteria in rhizosphere soil of healthy plants were higher than those of diseased plants.

Conclusion

Fusarium

wilt reduces the bacterial richness and diversity and triggers the enrichment of massive

Fusarium

fungi，

Pectobacterium

， and

Dickeya

. The proportion of beneficial bacteria in rhizosphere soil of healthy plants is significantly higher than that of diseased plants.

关键词

Keywords

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