基于网络药理学与分子对接技术探究冬虫夏草治疗支气管哮喘和慢性肾衰竭“异病同治”作用机制

连文静; 胡骏; 傅梦薇; 刘金垒; 刘咏梅; 王阶

doi:10.13422/j.cnki.syfjx.20220715

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基于网络药理学与分子对接技术探究冬虫夏草治疗支气管哮喘和慢性肾衰竭“异病同治”作用机制

数据挖掘 | 更新时间：2022-04-28

- 基于网络药理学与分子对接技术探究冬虫夏草治疗支气管哮喘和慢性肾衰竭“异病同治”作用机制
- Mechanism of Cordyceps in Treating Bronchial Asthma and Chronic Renal Failure with Concept of “Same Treatment for Different Diseases” Based on Network Pharmacology and Molecular Docking Technology
- 中国实验方剂学杂志 2022年28卷第11期页码：184-191
- 作者机构：
  
  1.中国中医科学院广安门医院，北京 100053
  2.北京中医药大学，北京 100029
- 作者简介：
  
  连文静，在读硕士，从事中西医结合防治心血管病研究，E-mail：17736908510@126.com
  王阶，教授，主任医师，博士生导师，从事中西医结合防治心血管病研究，E-mail：wangjie0103@126.com
- 基金信息：
  
  中医药传承与创新“百千万”人才工程（岐黄工程）(0201000401)
- DOI：10.13422/j.cnki.syfjx.20220715
  中图分类号： R285;R289;R22;R2-031;R33
- 收稿日期：2022-01-20，
  
  网络出版日期：2022-03-29，
  
  纸质出版日期：2022-06-05
- 稿件说明：
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连文静,胡骏,傅梦薇等.基于网络药理学与分子对接技术探究冬虫夏草治疗支气管哮喘和慢性肾衰竭“异病同治”作用机制[J].中国实验方剂学杂志,2022,28(11):184-191.

LIAN Wen-jing,HU Jun,FU Meng-wei,et al.Mechanism of Cordyceps in Treating Bronchial Asthma and Chronic Renal Failure with Concept of “Same Treatment for Different Diseases” Based on Network Pharmacology and Molecular Docking Technology[J].Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2022,28(11):184-191.
连文静,胡骏,傅梦薇等.基于网络药理学与分子对接技术探究冬虫夏草治疗支气管哮喘和慢性肾衰竭“异病同治”作用机制[J].中国实验方剂学杂志,2022,28(11):184-191. DOI： 10.13422/j.cnki.syfjx.20220715.

LIAN Wen-jing,HU Jun,FU Meng-wei,et al.Mechanism of Cordyceps in Treating Bronchial Asthma and Chronic Renal Failure with Concept of “Same Treatment for Different Diseases” Based on Network Pharmacology and Molecular Docking Technology[J].Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2022,28(11):184-191. DOI： 10.13422/j.cnki.syfjx.20220715.

摘要

目的

以中医“异病同治”理论为依据，采用网络药理学与分子对接方法探究冬虫夏草对支气管哮喘和慢性肾衰竭的作用机制。

方法

通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）及SwissTargetPrediction数据库检索获取冬虫夏草活性成分及潜在靶点，利用TTD、DrugBank、GeneCards等多数据库获取疾病靶点，将两者取交集获取共有靶点，通过STRING 11.5数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络，使用Cytoscape 3.9.0构建冬虫夏草“成分-靶点-疾病”网络，利用Metascape平台工具对共有靶点进行富集分析，运用Autodock 4.2软件进行分子对接。

结果

筛得疾病与药物共有靶点60个，核心靶点主要涉及蛋白激酶B1（Akt1）、非受体酪氨酸激酶肉瘤病毒蛋白（Src）、TP53、基质金属蛋白酶-9（MMP-9）、前列腺素G/H合酶2（PTGS2）等，潜在靶点主要富集在肾素-血管紧张素系统（RAS），Rap1，磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B（PI3K/Akt），丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）等多条信号通路中。

结论

冬虫夏草中多种活性成分通过多靶点、多途径发挥抑制炎症反应、降低纤维化和细胞凋亡作用，初步揭示了冬虫夏草“异病同治”支气管哮喘与慢性肾衰竭的潜在靶点与现代生物学机制，为深入研究开展实验及临床应用提供参考。

Abstract

Objective

To explore the mechanism of Cordyceps in treating bronchial asthma and chronic renal failure with the concept of "same treatment for different diseases" in traditional Chinese medicine （TCM） by network pharmacology and molecular docking technology.

Method

The active components and potential targets of Cordyceps were collected from Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform （TCMSP） and SwissTargetPrediction. The disease targets were obtained from Therapeutic Target Database （TTD）， DrugBank， GeneCards and other databases. The common targets were obtained from the intersection of potential targets and disease targets. The protein-protein interaction （PPI） network was constructed by STRING11.5， and the ''component-target-diseas'' network of Cordyceps was established by Cytoscape 3.9.0. Gene Ontology （GO） and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes （KEGG） enrichment analyses were carried out by Metascape， and molecular docking was performed by Autodock 4.2.

Result

Sixty common targets of disease and drug were screened out. The core targets mainly involved protein kinase B1 （Akt1）， non-receptor tyrosine kinase， sarcoma virus protein （SRC）， TP53， matrix metalloproteinase-9 （MMP-9）， and prostaglandin endoperoxide synthase 2 （PTGS2）. The potential targets were mainly enriched in the signaling pathways of renin-angiotensin system （RAS）， RAP1， phosphoinositide 3 kinase/protein kinase B （PI3K/Akt）， mitogen-activated protein kinase （MAPK）， etc.

Conclusion

The active components of Cordyceps inhibited inflammatory response and reduced fibrosis and cell apoptosis in a multi-target and multi-pathway manner. The findings of this study preliminarily revealed the potential targets and modern biological mechanism of Cordyceps in treating bronchial asthma and chronic renal failure with the concept of ''same treatment for different diseases''， and provided references for in-depth experimental verification and clinical application.

关键词

Keywords

references

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