1.中国中医科学院 中医临床基础医学研究所,北京 100700
2.中国中医药循证医学中心,北京 100700
3.中国中医科学院 中医基础理论研究所,北京 100700
4.中国中医科学院 中医药数据中心,北京 100700
5.中国中医科学院 中医药信息研究所,北京 100700
柴嘉琪,硕士,研究实习员,从事中医药信息学、中医药循证医学研究,E-mail:chaijq1109@163.com
文天才,博士,研究员,博士生导师,从事中医药真实世界研究,E-mail:wtcsnake@163.com; *
赵晖,博士,研究员,硕士生导师,从事中医诊断学、中医药循证医学研究,E-mail:huizh_1980@126.com
收稿:2023-08-18,
网络出版:2023-09-20,
纸质出版:2024-03-20
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柴嘉琪,谈钰濛,向兴华等.基于文献数据的知识图谱构建——以中医药治疗糖尿病周围神经病变为例[J].中国实验方剂学杂志,2024,30(06):144-150.
CHAI Jiaqi,TAN Yumeng,XIANG Xinghua,et al.Construction of Knowledge Graph Based on Literature Data by Taking Treatment of Diabetic Peripheral Neuropathy with Traditional Chinese Medicine as An Example[J].Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2024,30(06):144-150.
柴嘉琪,谈钰濛,向兴华等.基于文献数据的知识图谱构建——以中医药治疗糖尿病周围神经病变为例[J].中国实验方剂学杂志,2024,30(06):144-150. DOI: 10.13422/j.cnki.syfjx.20231448.
CHAI Jiaqi,TAN Yumeng,XIANG Xinghua,et al.Construction of Knowledge Graph Based on Literature Data by Taking Treatment of Diabetic Peripheral Neuropathy with Traditional Chinese Medicine as An Example[J].Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2024,30(06):144-150. DOI: 10.13422/j.cnki.syfjx.20231448.
目的
2
系统梳理现有文献中关于中医药治疗糖尿病周围神经病变(DPN)的“病-证-治-方-药”知识框架和概念逻辑关系,构建中医药治疗DPN的知识图谱,促进中医药治疗DPN的文献中隐性知识显性化。
方法
2
以中国知网中有关中医药治疗DPN的文献为主要数据来源,通过人工标引构建中医相关概念和实体,并建立实体之间的对应关系;利用Python 3.7处理形成结构化数据,并基于Neo4j 3.5.34图数据库构建知识图谱。
结果
2
该知识图谱在模式层定义了方剂、中药、证型等12种节点标签,以及包含、对应、选择、组成这4种关系类型,形成了具备中医诊疗逻辑的知识图谱,可支持中医药治疗DPN证候要素、证候类型、治法等节点及各节点之间关系的查询与发现。
结论
2
该研究基于文献数据探索性构建了中医药治疗DPN的知识图谱,汇聚了中医药治疗DPN的多种方式,包括内治法及外治法等,并从证素分析、证型组成至治法选择形成了辨证分型治疗DPN的全链条知识结构,可为文献数据服务于临床、科研工作提供新思路和新方法,并可为中医文献知识可视化、中医药知识服务智能化、中医标准化和规范化诊疗提供参考。
Objective
2
To systematically sort out the knowledge framework and conceptual logic relationship of "disease-syndrome-treatment-prescription-medicine" in the existing literature on traditional Chinese medicine(TCM) treatment of diabetic peripheral neuropathy(DPN), to construct of the knowledge map of TCM treatment of DPN, and to promote the explicitation of the implicit knowledge in the literature on the treatment of DPN with TCM.
Method
2
Taking the literature of China National Knowledge Infrastructure about TCM treatment of DPN as the main data source, TCM-related concepts and entities were constructed by manual citation, and the corresponding relationships between the entities were established. Structured data were formed by processing with Python 3.7, and the knowledge graph was constructed based on Neo4j 3.5.34 graph database.
Result
2
The resulting knowledge graph with TCM diagnosis and treatment logic, defined 12 node labels such as prescriptions, Chinese medicines and syndrome types at the schema layer, as well as 4 types of relationships, such as inclusion, correspondence, selection and composition. It could support the query and discovery of nodes(syndrome elements, syndrome types and treatment methods), as well as the relationship between each node.
Conclusion
2
Based on the literature data, this study constructed a knowledge map for TCM treatment of DPN, which brought together various methods of TCM treatment of DPN, including internal and external treatment. The whole chain knowledge structure of syndrome differentiation and classification for DPN treatment is formed from syndrome element analysis, syndrome type composition to treatment method selection, which can provide new ideas and methods for literature data to serve clinical and scientific research work, as well as reference for visualization of TCM literature knowledge, intellectualization of TCM knowledge services and the standardization of TCM diagnosis and treatment.
涂世伟 , 陈龙菊 . 中医药治疗糖尿病周围神经病变的研究进展 [J]. 中国民族民间医药 , 2021 , 30 ( 10 ): 73 - 76 .
秦芳芳 , 张岩 . 基于CiteSpace的中药治疗糖尿病周围神经病变知识图谱的可视化分析 [J]. 西部中医药 , 2022 , 35 ( 10 ): 85 - 89 .
庞国明 , 孙扶 , 谢卫平 , 等 . 中医药治疗糖尿病周围神经病变临床研究进展 [J]. 世界中西医结合杂志 , 2020 , 15 ( 12 ): 2339 - 2342 .
缪鋆鋆 , 葛静 . 中西医治疗糖尿病周围神经病变研究进展 [J]. 河南中医 , 2017 , 37 ( 4 ): 742 - 744 .
张梦婷 , 张兰 , 张颖 , 等 . 基于CiteSpace的中医药治疗糖尿病周围神经病变知识图谱可视化分析 [J]. 实用中医内科杂志 , 2022 , 36 ( 6 ): 98 - 101,152 .
冯圣钰 , 杨华 , 邹冉 , 等 . 中医治疗糖尿病周围神经病变的研究进展 [J]. 世界临床药物 , 2021 , 42 ( 9 ): 751 - 756 .
侯梦薇 , 卫荣 , 陆亮 , 等 . 知识图谱研究综述及其在医疗领域的应用 [J]. 计算机研究与发展 , 2018 , 55 ( 12 ): 2587 - 2599 .
PAULHEIM H . Knowledge graph refinement:A survey of approaches and evaluation methods [J]. Semant Web , 2017 , 8 ( 3 ): 489 - 508 .
NICKEL M , MURPHY K , TRESP V , et al . A review of relational machine learning for knowledge graphs [J]. Proc IEEE , 2015 , 104 ( 1 ): 11 - 33 .
WANG Q , MAO Z , WANG B , et al . Knowledge graph embedding:A survey of approaches and applications [J]. IEEE Trans Knowl Data Eng , 2017 , 29 ( 12 ): 2724 - 2743 .
王松 , 李正钧 , 杨涛 , 等 . 中医药知识图谱研究现状及发展趋势 [J]. 南京中医药大学学报 , 2022 , 38 ( 3 ): 272 - 278 .
MARTÍNEZ-ROMERO M , VÁZQUEZ-NAYA J M , PEREIRA J , et al . The iOSC3 system:Using ontologies and SWRL rules for intelligent supervision and care of patients with acute cardiac disorders [J]. Comput Math Methods Med , 2013 , 2013 : 650671 .
MOURÃO A , MARTINS F , MAGALHAES J . Multimodal medical information retrieval with unsupervised rank fusion [J]. Comput Med Imaging Graph , 2015 , 39 : 35 - 45 .
DENG Y , XIE Y X , LI Y L , et al . Contextualized knowledge-aware attentive neural network:Enhancing answer selection with knowledge [J]. ACM T Inform Syst , 2021 , 40 ( 1 ): 1 - 33 .
胡振生 , 杨瑞 , 朱嘉豪 , 等 . 大语言模型在医学领域的研究与应用发展 [J]. 人工智能 , 2023 ( 4 ): 10 - 19 .
张雨琪 , 李宗友 , 王映辉 , 等 . 中医药知识图谱的构建与应用研究 [J]. 世界中医药 , 2022 , 17 ( 4 ): 553 - 558 .
李芊芊 , 付兴 , 杨凤 , 等 . 基于“病脉证并治”诊疗思维的《伤寒论》知识图谱构建与应用 [J]. 世界科学技术—中医药现代化 , 2022 , 24 ( 9 ): 3613 - 3621 .
戎菲 , 佟旭 , 胡镜清 . 中医药知识图谱应用现状分析及痴呆痰瘀互结证知识图谱构建探索 [J]. 世界科学技术—中医药现代化 , 2021 , 23 ( 7 ): 2454 - 2460 .
王菁薇 , 肖莉 , 晏峻峰 . 基于Neo4j的《伤寒论》知识图谱构建研究 [J]. 计算机与数字工程 , 2021 , 49 ( 2 ): 264 - 267,396 .
刘凡 , 王明强 , 李凌香 , 等 . 名老中医临床经验知识图谱构建方法探索 [J]. 中华中医药杂志 , 2021 , 36 ( 4 ): 2281 - 2285 .
温思琦 . 基于本体的中医冠心病自动问答系统的设计与实现 [D]. 沈阳 : 沈阳工业大学 , 2017 .
阮彤 , 孙程琳 , 王昊奋 , 等 . 中医药知识图谱构建与应用 [J]. 医学信息学杂志 , 2016 , 37 ( 4 ): 8 - 13 .
付子轩 , 周鹏 , 任海燕 , 等 . 基于知识图谱的中西医结合急腹症诊疗推理分析 [J]. 中国实验方剂学杂志 , 2023 , 29 ( 11 ): 190 - 199 .
屈丹丹 . 基于知识图谱的肺癌医案四诊信息组合规律挖掘研究 [D]. 南京 : 南京中医药大学 , 2021 .
卢克治 . 基于中医古籍的知识图谱构建与应用 [D]. 北京 : 北京交通大学 , 2020 .
刘金垒 , 惠小珊 , 张振鹏 , 等 . 基于中医诊疗指南的冠心病知识图谱构建 [J]. 中国实验方剂学杂志 , 2023 , 29 ( 7 ): 208 - 215 .
朱文锋 . 证素辨证学 [M]. 北京 : 人民卫生出版社 , 2008 .
钟赣生 , 杨柏灿 . 中药学 [M]. 北京 : 中国中医药出版社 , 2021 .
GONG F M , MA Y H , GONG W J , et al . Neo4j graph database realizes efficient storage performance of oilfield ontology [J]. PLoS One , 2018 , 13 ( 11 ): e0207595 .
KANG S X , ZHONG Y M , LIU D H , et al . Traditional Chinese medicine fumigation as auxiliary treatment of diabetic peripheral neuropathy:A protocol for systematic review and meta-analysis [J]. Medicine , 2021 , 100 ( 4 ): e24200 .
YANG Y , ØSTBYE T , TAN S B , et al . Risk factors for lower extremity amputation among patients with diabetes in Singapore [J]. J Diabetes Complications , 2011 , 25 ( 6 ): 382 - 386 .
李硕 , 孙悦阳 , 樊景春 , 等 . 基于CiteSpace的中医药治疗便秘的知识图谱可视化分析 [J]. 中国实验方剂学杂志 , 2023 , 29 ( 4 ): 167 - 175 .
陶雨彤 , 陈云筝 , 邵兰仪 , 等 . 中医药知识图谱的构建与应用探讨 [J]. 北京中医药 , 2022 , 41 ( 12 ): 1387 - 1392 .
石英杰 . 基于病机模型的胸痹病中医智能辅助诊断方法研究 [D]. 北京 : 中国中医科学院 , 2021 .
曾子玲 , 张华敏 , 于彤 , 等 . 知识图谱及其关键技术在中医药领域的研究与应用综述 [J]. 世界科学技术—中医药现代化 , 2022 , 24 ( 2 ): 780 - 788 .
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